Il y a une diffence de structure cellulaire. La bactérie n'a pas de noyau, elle est dite prokaryote. Le champignon lui a un noyau à l'intérieur de sa ou ses cellules et dit eucaryote. De plus, une bactérie est toujours unicellulaire tandis que le champignon peut être unicellulaire comme les levures ou puricellulaire comme le champignon de Paris.
